Научными коллективами университета ведутся фундаментальные и прикладные исследования в рамках следующих основных научных направлений:
- применение вычислительной техники, математического моделирования и математических методов в научных исследованиях;
- новые педагогические технологии в обучении иностранным языкам;
- организационно-педагогические условия подготовки специалистов;
- история Сибири;
- методологические основания общей теории образования;
- традиционализм и модернизм в современном литературном процессе;
- совершенствование методики физического воспитания, спортивной тренировки и спортивно-оздоровительной работы;
- управление оплатой труда в условиях рыночной экономики в основных сферах народного хозяйства.